Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsm14bQ8CGC4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm14bQ8CGC4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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