Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx8Q8CFD4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx8Q8CFD4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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