Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nkiras1Q8CEC5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkiras1Q8CEC5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkiras1Q8CEC5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.1 ms