Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
9030612E09RikQ8CE20 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9030612E09RikQ8CE20 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms