Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CCC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CCC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CCC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CCC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CCC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CCC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CCC3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CCC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q8CCC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CCC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CCC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CCC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CCC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CCC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms