Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb1Q8CBF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ephb1Q8CBF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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