Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrip1Q8CBD1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrip1Q8CBD1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms