Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo48Q8CAT8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo48Q8CAT8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms