Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podxl2Q8CAE9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podxl2Q8CAE9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podxl2Q8CAE9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms