Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A430089I19RikQ8C9W1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A430089I19RikQ8C9W1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms