Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp20Q8C6M1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp20Q8C6M1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp20Q8C6M1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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