Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4bQ8C6J9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4bQ8C6J9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4bQ8C6J9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms