Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5X1

4931406P16Rik, RIKEN cDNA 4931406P16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406P16RikQ8C5X1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4931406P16RikQ8C5X1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4931406P16RikQ8C5X1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4931406P16RikQ8C5X1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms