Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933409G03RikQ8C5U0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms