Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4H2

Samd3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd3Q8C4H2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd3Q8C4H2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Samd3Q8C4H2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd3Q8C4H2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms