Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac7Q8C2B3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac7Q8C2B3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac7Q8C2B3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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