Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc3aQ8BX90 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3aQ8BX90 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms