Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skor1Q8BX46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Skor1Q8BX46 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skor1Q8BX46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms