Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3dQ8BX13 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube3dQ8BX13 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube3dQ8BX13 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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