Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr9Q8BV84 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr9Q8BV84 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr9Q8BV84 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms