Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pggt1bQ8BUY9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pggt1bQ8BUY9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pggt1bQ8BUY9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms