Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV1

Tusc3, Tumor suppressor candidate 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc3Q8BTV1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tusc3Q8BTV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tusc3Q8BTV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tusc3Q8BTV1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tusc3Q8BTV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tusc3Q8BTV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tusc3Q8BTV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tusc3Q8BTV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tusc3Q8BTV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms