Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AtripQ8BMG1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtripQ8BMG1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AtripQ8BMG1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtripQ8BMG1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms