Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smoc1Q8BLY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smoc1Q8BLY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smoc1Q8BLY1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smoc1Q8BLY1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms