Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc2Q8BKV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc2Q8BKV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpc2Q8BKV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms