Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf41Q8BH75 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf41Q8BH75 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf41Q8BH75 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms