Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChfrQ810L3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ChfrQ810L3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChfrQ810L3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChfrQ810L3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChfrQ810L3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ChfrQ810L3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChfrQ810L3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChfrQ810L3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChfrQ810L3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms