Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smim19Q80ZU4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smim19Q80ZU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Smim19Q80ZU4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Smim19Q80ZU4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim19Q80ZU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Smim19Q80ZU4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Smim19Q80ZU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Smim19Q80ZU4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Smim19Q80ZU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Smim19Q80ZU4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms