Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pkhd1l1Q80ZA4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pkhd1l1Q80ZA4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Pkhd1l1Q80ZA4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pkhd1l1Q80ZA4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pkhd1l1Q80ZA4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pkhd1l1Q80ZA4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pkhd1l1Q80ZA4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkhd1l1Q80ZA4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkhd1l1Q80ZA4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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