Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TnnQ80Z71 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TnnQ80Z71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TnnQ80Z71 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TnnQ80Z71 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC36■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TnnQ80Z71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TnnQ80Z71 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TnnQ80Z71 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms