Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec16aQ80U30 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec16aQ80U30 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec16aQ80U30 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec16aQ80U30 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec16aQ80U30 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec16aQ80U30 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec16aQ80U30 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms