Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
NischQ80TM9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC46.18■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC46.17■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC46.14■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
NischQ80TM9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC46.12■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC46.12■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
NischQ80TM9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC46.01■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
NischQ80TM9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
NischQ80TM9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC45.92■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
NischQ80TM9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
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