Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ppp6r1Q7TSI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppp6r1Q7TSI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp6r1Q7TSI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp6r1Q7TSI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms