Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnf1Q7TSH7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnf1Q7TSH7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms