Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1cQ7TSF0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1cQ7TSF0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms