Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn1Q7TPR4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn1Q7TPR4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn1Q7TPR4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms