Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Prrc2bQ7TPM1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Prrc2bQ7TPM1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prrc2bQ7TPM1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prrc2bQ7TPM1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms