Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HhipQ7TN16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HhipQ7TN16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HhipQ7TN16 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HhipQ7TN16 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms