Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uhrf2Q7TMI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf2Q7TMI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms