Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms