Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Topbp1Q6ZQF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Topbp1Q6ZQF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Topbp1Q6ZQF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms