Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nemp1Q6ZQE4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nemp1Q6ZQE4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms