Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp34Q6ZQ93 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp34Q6ZQ93 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms