Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NinlQ6ZQ12 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NinlQ6ZQ12 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NinlQ6ZQ12 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NinlQ6ZQ12 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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