Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chsy1Q6ZQ11 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy1Q6ZQ11 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms