Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot1Q6ZQ08 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms