Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg5Q6ZPY2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg5Q6ZPY2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg5Q6ZPY2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Smg5Q6ZPY2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms