Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd4Q6ZPR5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smpd4Q6ZPR5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms