Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx55Q6ZPL9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx55Q6ZPL9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx55Q6ZPL9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx55Q6ZPL9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms