Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LcorQ6ZPI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LcorQ6ZPI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms